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TUhjnbcbe - 2023/11/8 18:28:00
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逆转录(reversetranscription)是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成,逆转录实验包括3大要素,分别是引物、逆转录酶和RNA模板:

1.引物:逆转录引物主要有3种,包括Oligo(dT)、RandomPrimers和基因特异性引物(GSP)。其中Oligo(dT)具有12-20个T碱基,并且与真核生物mRNA的3’PolyA尾配对,可合成全长的cDNA,但仅扩增有polyA尾的mRNA,对模板质量要求高,较适合克隆实验。而RandomPrimers具有6-9个碱基,可随机识别模板并结合,适合复杂结构和微量模板,但特异性低,小片段多,适合后续qPCR实验。基因特异性引物可以识别特定模板序列,具有特异性强,灵敏度高的特点,但需合成特定的序列。所以根据不同实验需求可进行相应引物的选择。

2.逆转录酶:一种是来自纯化的禽成髓细胞瘤病*(AMV),由两条肽链组成,具有聚合酶活性和很强的RNaseH活性,它最适温度是42℃,最适pH8.3,在高反应温度时可消除mRNA的二级结构对逆转录的阻碍,然而高水平的RNaseH的活性既抑制cDNA产生也限制其长度。另一种来源于鼠白血病病*(M-MLV),是单肽链的,有RNA聚合酶活性和相对较弱的RNaseH活性,最适温度37℃,最适pH7.6,较弱的RNaseH活性对获得2-3kb的mRNA的全长cDNA有很大好处。

3.RNA模板:通常利用紫外分光光度计检测纯度,要求A/=1.9~2.1,A/=2.0~2.2。利用琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整度,完整的总RNA在进行琼脂糖凝胶电泳时会产生清晰的28S和18SrRNA条带(真核样品),28SrRNA条带的强度应当大致为18SrRNA条带的两倍,并且无gDNA和蛋白残留。

上图琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性
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