溶菌酶（Lysozyme）又称胞壁质酶（Muramidase），存在于卵清、唾液等生物分泌液中，能够催化细菌细胞壁肽聚糖N-乙酰氨基葡糖和N-乙酰胞壁酸之间的β-1，4糖苷键的水解。当与带负电荷的病毒蛋白相互结合时，溶菌酶能够与DNA、RNA、脱辅基蛋白形成复盐，这种复盐可使病毒失去活力。蛋清溶菌酶是目前研究最为透彻的一种溶菌酶。本例中就以鸡蛋清溶菌酶为例，为大家演示使用Gromacs完成其在水中的动力学模拟。考虑到许多同学不熟悉Linux系统的操作，本例所有操作均可在Windows系统下完成，关于Windows系统下Groamcs的安装，大家可参考下面这篇博文：