基因功能研究思路,简单来讲是在进行芯片或者测序得到基因后,筛选肿瘤组织与正常组织之间的差异表达基因。下一步即肿瘤细胞中进行目的基因的沉默与过表达,探究这些基因在肿瘤发生过程中的作用。
之前为大家介绍了过表达质粒选择(点击进入),今天为大家介绍过基因表达的技术中目的基因获取。
首先,根据目的基因CDS序列的长短,可以通过两种方法获取目的基因序列:
(1)设计CDS引物,通过提取组织RNA,并设计相应引物,运用PCR的方法获得目的基因CDS序列,连接到克隆载体后,挑取单克隆进行测序。这种方法相对成本较低,但是PCR过程可能引入突变。适合基因CDS序列较短的情况。
(2)全基因合成:根据目的基因的CDS序列,直接交给公司设计合成目的基因。此方法优点准确性高,相对成本会高一些,需要专业的合成公司完成。适合基因CDS序列较长或者人工改造的任何基因序列。有些公司会将目的CDS序列连接至克隆质粒载体上,此时我们可以通过两种方法获得:A:CDS两端限制性内切酶进行酶切,将酶切后片段通过胶回收方式连接至载体。B:设计引物将CDS区通过PCR方法获取,注意如果序列较长,最好使用高保真酶,防止PCR过程中碱基突变。
下面以人类基因为例,介绍下第一种方法中目的基因的获取。
1目的基因的CDS序列获取
1.进入NCBI数据库(